慶長六年（1601年）
三月二十八日，秀保嫡子竹王丸元服，秀保為其取名豐臣秀滿，寓意如足利義滿，成為有為之君；前田利家為其烏帽子親；
八月十一日，秀保養母智雲院病逝，與豐臣秀長合葬，全國大名皆遣人哀悼；
九月初，德川家康正是往高野山出家，卸任內大臣；
十月初，秀保繼任左大臣，成為百官之首，石田三成等人忌憚之。
慶長七年（160年）
一月十二日，前田利家病逝，朝廷贈從二位內大臣，秀保親護送遺體至金澤；
三月初三，石田三成往大阪覲見秀賴，告知茶茶小心秀保，茶茶不以為然；
四月初八，秀保聽從藤堂高虎建議，以天下安泰且大老奉行制度已過時為由廢除大老奉行聯席會議，以自己和宇喜多秀家、前田利政處理朝政，石田三成自覺秀保有意將自己排除在外，加緊與各地不滿秀保勢力接觸；
四月十八，島津忠恆上洛向秀保臣服，決定交出薩摩移居大隅，秀保寬恕之；
八月中旬，小早川秀秋病逝，由於無子嗣繼承，所領兩國納入藏入地；
十月初，石田三成請求上洛面見秀賴，秀保以未到年關為由婉拒，三成遂遣人入京造謠秀保有意代替秀賴成為關白；
十二月上旬，受謠言蠱惑，松浦秀任、速水守久、石田三成、增田長盛、郡宗保五人聯名上書，要求秀保做出解釋，史稱“五臣上書”。
慶長八年（160年）
元月初五，秀保於伏見召集眾大名，決定為避免謠言四起，放棄羽柴苗字，改苗字回“三好”，以表自己絕無篡奪關白之意；然而，會上小笠原忠清展示小笠原氏家譜，表明三好氏名為小笠原氏分家，實則源義忠嫡子河內經國正統血脈；
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（源義忠乃是河內源氏棟樑，義忠遇害後，其子源經國年幼，遂由侄子源為義繼任源氏棟樑。源為義乃是源賴朝祖父，源賴朝更是鎌倉幕府的創始人，若是秀保能證明自己是河內經國直系血脈，便意味著他才是真正的源氏棟樑，而源賴朝一脈，不論是足利還是德川，都只是旁支分家！）
此言一出，全場譁然，雖有人不信，但書證俱在，小笠原忠清言之鑿鑿，且秀保實力強大無人可以撼動，無奈之下，眾人只好接受這一事實，承認秀保為源氏棟樑；
三月初三，朝廷正是頒佈敕令，敕封秀保為源氏棟樑，秀保乘勢更名為河內保國，嫡子更名為河內滿國，庶長子更名為河內光國，次子更名為河內政國，四子更名為河內勝國，五子更名為河內利國。
八月十五，徵夷大將軍宣下，秀保正式被任命為徵夷大將軍，於伏見開幕，史稱“桃山幕府”或者“河內幕府”；全國大名前來朝賀，石田三成未曾想自己竟然促成秀保成為武家棟樑，無奈之下只好稱病派遣嫡子前去道賀。
慶長十年（1605年）
八月十三，德川秀康病逝，嫡子德川忠直繼承結城藩五十三萬五千石，根據秀康死前請求，秀保決議將長女淘姬下嫁給忠直。
慶長十三年（1606年）
元月十二，宇都宮國綱病逝，嫡子宇都宮義綱繼承宇都宮藩二十五萬石，迎娶秀保養女、福井藩主那須資吉長女為正室。
元月二十五日，津輕為信病逝，三子津輕信枚繼承弘前藩四萬五千石。
慶長十四年（1609年）
五月三日，京極高次病逝，長子京極忠高繼承八上藩二十八萬石，迎娶秀保養女、三木藩主福島高吉長女為正室。
五月初，豐臣秀賴晉升為從二位內大臣，然眼疾未愈，性情暴戾跋扈，茶茶數次險些被其砍傷，更有無數侍從死於其刀下，坊間遂稱其為“殺生內府”，豐臣氏權威面臨外界質疑；
六月初八，聽從菊姬建議，秀保以嫡五子河內利國繼承大和豐臣氏，再度更名為羽柴利國，統稱豐臣利國，繼承中南大和三十四萬石領地，居城郡山城，史稱“郡山藩”
九月二十日，淺野長政病逝，秀保遣人前往悼念，特免除淺野幸長三年參覲交代，幸長感激，以嫡子入侍秀保。
慶長十五年（1610年）
二月，滝川雄利病逝，無嗣，王土奉還，伊勢神戶藩滅亡。
十月，小倉藩主細川忠興之父細川幽齋病逝。
十二月，德川氏重臣本多忠勝病逝。
慶長十六年（1611年）
四月初，秀保以庶長子河內光國繼承西近江三十六萬石，居城坂本，史稱“坂本藩”；
六月初，秀保以庶次子河內政國繼承中南伊勢三十五萬七千石，居城津，史稱“津藩”；
八月初，秀保以庶四子河內勝國繼承紀伊大部三十三萬石，居城大宮，史稱“大宮藩”；
慶長十七年（161年）
九月中，織田秀信病逝，家中發生騷亂，庶長子刺殺嫡次子，惡行被家臣告之秀保，秀保大怒，將岐阜織田家改易，有功家臣收入秀保麾下，庶長子處死，領地納入藏入地。
十一月中，應阿江請求，秀保以河內勝國更名豐臣勝國，領有岐阜、巖村三十三萬石，居城岐阜，史稱“岐阜藩”；
十二月八日，豐臣秀賴揮刀砍傷茶茶，秀保前往大阪勸諫，秀賴向茶茶道歉，內心卻憎恨秀保；當晚秀保於茶茶寢室留宿勸慰（並無苟且之事），恰被小姓撞見，告知秀賴，秀賴憤恨交加，計劃刺殺秀保。
慶長十八年（161年）
元月二十五日，池田輝政病逝，嫡子池田利隆繼承春日山藩四十一萬石。
三月初八，豐臣秀賴暗中聯絡石田三成和增田長盛，意圖於豐臣秀吉忌日行刺秀保，三成大驚，立即寫信阻止，增田長盛也命次子回信秀賴，讓其繼續忍耐，然次子擔心惹禍上身，將書信交於長崎奉行後藤基次，基次立即派人告知秀保；
五月十二，秀保得信，親往大阪質問秀賴，秀賴惱羞成怒，拔刀亂砍，未曾想竟砍中前來制止的茶茶；
五月十四，夜，茶茶傷重不治於秀保懷中逝世，秀保大怒，決議廢除秀賴豐臣棟樑之位，諸大名聽聞，表現各不相同；
五月十五，秀保召長子河內光國、三木藩主福島高吉率兵一萬進入大阪，強行替換城內守軍，將豐臣秀賴軟禁於大阪本丸；
五月十七，秀保頒佈教令，以秀賴嗜殺殘暴、弒母跋扈為由廢除其豐臣棟樑之位，由其子國松繼承大阪豐臣氏家業；
六月二十九，水戶藩主石田三成、黑木藩主增田長盛、安曇藩主速水守久、松任藩主松浦秀任、小松藩主郡宗保欲對秀保發動兵諫，福島正則和加藤嘉明也上書秀保，希望其能三思而行；
七月十五，念及眾人反對，秀保妥協，仍以豐臣秀賴為豐臣棟樑，卻以“弒殺主母，乖張暴虐”為由削減其山城、和泉兩國封地，秀賴則入伏見向秀保請罪臣服，六十七萬石的大阪藩正式成立。
八月二十五日，淺野幸長病逝，無嗣，二弟淺野長晟繼承越前府中藩三十八萬石。
慶長十九年（1614年）
元月十八日，最上義光病逝，次子最上義親繼承山形藩五十四萬石，並為嫡子迎娶秀保與駒姬侄女天滿姬為正室。
四月初七，秀保將山城國西南三萬石奉為天皇御料地，天皇大喜，欲封其為太政大臣，秀保堅辭不就。
九月初九，秀保前往豐國神社拜謁秀吉和秀長，巧遇秀賴，秀保告知將從明國請神醫為其治療眼疾，秀賴拜謝；
慶長二十年（1615年）
元月初三，名醫張景嶽奉萬曆帝之命前往大阪為豐臣秀賴治療眼疾，然由於眼疾拖延日久，張景嶽亦無能為力；
元月二十六，張景嶽經任那返回大明，臨行前告誡秀賴平心靜氣，注意調養也許有康復的餘地，秀賴聽罷若有所思；
三月初五，秀賴決意如高野山清修以治療眼疾，秀保應允，乃以片桐且元為大阪城代，令河內光國與福島高吉撤兵返回本領；
五月下，秀賴於山中偶遇德川家康，家康趁機進讒言，唆使秀賴召集豐臣舊臣起兵推翻秀保；
六月中，秀賴寫信詢問石田三成，石田深知家康陰險，堅決不允，然秀賴仍為家康說服，準備返回大阪起事；
八月二十八，秀賴正室、家康之孫女千姬誕下嫡長子，取名鶴松，秀賴得知大喜，更加堅定奪取屬於自己的天下；
九月初九，秀賴藉口祭祀秀吉返回大阪，不顧片桐且元勸說憤然起事，傳檄天下，史稱“菊節の變”；當天傍晚，秀賴發兵奪取和泉，未料被堺奉行中藤信友擊敗，損失百餘人後倉皇撤回大阪；秀保連夜號令河內光國、豐臣利國、福島高吉、京極忠高率領四萬人包圍大阪；
九月初十，越前大聖寺藩主伊東長實、松任藩主松浦秀任、小松藩主郡宗保起兵響應豐臣秀賴，前田利政、那須資吉受命出兵鎮壓，史稱“越前騷亂”；
九月十二，那須資吉攻陷大聖寺；
九月十三，秀保率領御馬廻四萬抵達大阪城外，要求豐臣秀賴投降；
九月十四，前田利政攻陷小松城，石田三成趕往大阪向秀保求情；
九月十五，原七手組組頭、信濃安曇藩主速水守久起兵響應越前騷亂，真田信繁和小笠原忠清領兵鎮壓；
九月十六，前田利政攻陷松任城，越前騷亂平息；秀保答應石田三成，只要秀賴出城請罪，便既往不咎，三成大喜，立即入城勸諫；
九月十七，速水守久兵敗被俘，小笠原忠清親自押往伏見；傍晚，豐臣秀賴接受石田三成建議，開城投降，“菊節之變”平息；
九月十九，秀保遵守約定，下令赦免豐臣秀賴，然越前三藩及安曇藩遭到廢藩，除了速水守久外，其餘三位藩主全都陣亡，秀保故不予追究，允許秀賴招募速水為家臣俸祿兩千石；石田三成返回水戶；
九月二十二，秀保與秀賴密談至深夜；
九月二十三，秀保決定將和泉國封給秀賴庶長子國松（堺港仍屬幕府直轄），知行十一萬石，居城岸和田，後世稱為“岸和田藩”；
十二月八日，奉秀保之命，以心崇傳和藤堂高虎擬定《武家諸法度》以及《禁中並公家諸法度》，以約束大名和公卿，這被後世認為是強化幕府權力的一項重要舉措。
慶長二十一年（1616年）
三月初，努爾哈赤於赫圖阿拉建國，定都赫圖阿拉，史稱“後金”，秀保聞訊，立即遣人往赴北京，提醒大明提早應對，然明神宗認為女真恭順，而倭人非大明子民，有意挑撥，遂對秀保的提醒置之不理；秀保深感大明大難將至，遂於任那動員軍勢三萬，派遣福島、那須等猛將前往訓練，以備萬全；
五月二十二，德川家康病逝，秀保命史官為其立傳，由於感慨天下已定，戰國時代徹底終結，秀保奏請朝廷，明年改年號為“永寧”，以祈求天下安寧；
七月十七，秀保側室菊亭持子難產而死，秀保撰文哀悼；
十一月三日，面對基督教的蔓延，秀保決定貫徹豐臣秀吉時代的《伴天連追放令》，驅逐外國傳教士出境並且將傳教與南蠻貿易嚴厲區分開來，對信仰基督教的大名進行限制，希望他們放棄基督教信仰；同時加強神佛習合力度，用以抗衡和削弱基督教在日本的影響。
永寧元年（1617年）
七月十六，芳春院病逝。
八月初，秀保自覺天下已定，為避免重蹈德川幕府覆轍，決定加強中央集權，先後頒佈《一城一國令》、《王土奉還令》和《推恩令》，史稱“永寧三令”，準備逐漸削弱地方大名權力，實現中央集權；
九月十五日，後陽成天皇病逝，秀保舉薦原豐臣秀吉養子、後陽成之弟八條宮智仁親王為天皇，是為後水尾天皇；
十月十三日，不滿秀保政策的山形藩主最上義親（兄弟矛盾尖銳）、仙台藩主伊達政宗（子嗣眾多）以及佐土原藩主島津忠恆（兩者皆有）等十餘家大名聯合抵制，並動員領內軍備不惜與秀保一戰，史稱“丁巳之亂”；石田三成奔走勸告，甚至豐臣秀賴出馬亦沒有太大緩和；秀保對此早有準備，他一方面調動軍隊積極備戰，另一方面利誘大名家中的支持者（如庶長子和兄弟等），從內部分化反對勢力；
十月二十八日，最上義親三弟清水義清於米澤城起兵，作為先鋒攻打山形城，蒲生秀行、上杉景勝領兵呼應；伊達政宗庶子也於當夜刺殺伊達政宗於仙台本丸，伊達家陷入混亂；
十一月三日，最上義親兵敗自殺，秀保以清水義清為最上氏家督，繼承山形十五萬石，仍稱山形藩，四弟山野邊義忠繼承米澤周邊十二萬石，是為米澤藩，莊內、由利等領地納入天領，秀保派專人管理；
十一月五日，伊達政宗次子開啟仙台城門，迎接蒲生、宇都宮軍進城，按照《推恩令》及《王土奉還令》，秀保將仙台藩六十八萬石分成五份，其中天領二十萬石，政宗四子瓜分剩餘四十八萬石；
十一月中，反對大名相繼被害或投降，十餘藩被肢解至四十藩，僅剩島津忠恆不願投降；
十一月二十日，島津義弘召開評定，廢黜忠恆家督之位，開城迎接豐臣軍；秀保將佐土原藩肢解為三家，並沒收西大隅為天領，“丁巳之亂”平息。
永寧二年（1618年）
四月中，努爾哈赤以“七大恨”起兵，率軍兩萬攻打撫順城，後金大勝，連下東州﹑馬根單﹑撫順三城，俘獲人畜三十餘萬；
七月中，努爾哈赤又親領大軍從鴉鶻關入明，攻破了清河城，副總兵鄒儲賢所部明軍被殲；
七月二十一，島津義弘病逝，其領地被納為天領；
八月初，秀保得知明軍慘敗，派遣長子河內光國及藤堂高虎往赴北京，提醒萬曆帝萬不可輕視女真，萬曆帝是才感慨秀保之忠，聽從秀保建議，加強邊防，關閉榷場，避免重蹈覆轍，同時決定召集明軍、女真葉赫部及日本任那駐軍共計十二萬攻打後金都城赫圖阿拉；與此同時，秀保動員軍士兩萬，準備於圖們登陸，百里奔襲，從背後偷襲赫圖阿拉；
永寧三年（1619年）
二月中，由於秀保戰前之建議，聯軍步步為營，劉挺也未如歷史上那般貪功冒進，而是效仿努爾哈赤“任爾幾路來，我只一路去”的戰略方針，採取碾壓堡壘式作戰方案，逐步向赫圖阿拉靠攏；與此同時，島清興從圖們登陸，與背後襲擾後金軍，使得努爾哈赤首尾不得兼顧，傷亡慘重；
三月初一，明軍復克撫順、清河；島清興於東州擊殺皇太極；
三月初四，明軍完成對赫圖阿拉包圍；
三月初八，紅夷大炮運抵，全城被夷為平地；
三月初九，努爾哈赤開城，愛新覺羅一族被屠，後金滅亡；葉赫部大肆屠殺後金遺臣；
三月二十日，應秀保建議，大明決定加強對東北的控制，遷徙內地漢人往東北居住；此後十五年間，東北漢人飆升至五百萬，足跡遍及外興安嶺和庫頁島；
四月初十，為表秀保之功，萬曆帝宣佈以親王之禮待之，取消勘合貿易，准許兩國自由貿易；
五月初十，秀保親往北京覲見萬曆帝，萬曆帝破例召見，秀保以一秘密告之，帝大驚，兩人徹夜長聊。（未完待續）