約瑟夫·阿基諾順利入主馬拉卡南宮後，迅速進行了一系列的人事變動，政府中杜爾特提拔上來的官員以各種藉口被彈劾或直接撤職，在菲律賓政府中想要找出一個沒有任何汙點的官員根本不可能，可以說被替換掉的官員沒有一個是冤枉的。
軍隊是人事調整要血腥的多，菲德爾·阿基諾少將麾下的特種作戰團對支援杜爾特總統的北呂宋軍區和國家首都軍區的主要將領展開了“斬首”行動，沒有防備的兩個軍區的主要指揮官悉數遇刺。國家首都軍區的第1步兵師在師部機關被特種作戰團襲擊後，兩個步兵連和憲兵部隊在各自軍官的帶領下對襲擊師部的特種部隊展開了攻擊，五十多名特種部隊被暴怒的第1步兵師官兵直接全部打死。直到菲德爾·阿基諾少將調來了更多的部隊和輕型快反連才平息了第1步兵師的爭鬥，差點讓這場一帆風順的政變出現了意外，要知道第1步兵師就駐紮在馬尼拉市郊區，一旦該師被組織起來全面反抗的話，接手馬尼拉市都沒有太大的問題，阿基諾家族在馬尼拉市擁有的力量只有菲德爾·阿基諾少將的特種部隊，特種作戰部隊的多支部隊在其他地區執行任務，馬尼拉市的兵力也就千餘人。
兩天的血雨腥風，讓約瑟夫·阿基諾順利控制了整個菲律賓，至於杜爾特總統，在畏罪潛逃的途中遭遇車禍身亡，屍體已經被火化。名聲已經被約瑟夫·阿基諾弄臭的杜爾特總統已經快速被遺忘了，在骯髒的政治中這樣的事情很是常見。
至於被作為引子的“珍珠”號遊輪，新成立的阿基諾四世政府，選擇了以保護遊客生命為第一要務，同摩伊組織展開了談判，在支付了三千萬美元的贖金後，所有人質獲釋。在人質獲釋後的當天夜間，菲律賓特種部隊突襲了摩伊組織的一處秘密營地，擊斃摩伊組織武裝人員十七人，算是給被殺死的遊客一個交代。
上臺之後的約瑟夫·阿基諾總統宣佈廢除杜爾特執政時期與中國政府簽署的一系列出賣菲律賓權益的合同，與美國、日本和澳大利亞展開廣泛合作。同時考慮到中國軍隊控制了臺灣島，嚴重威脅到呂宋海峽和呂宋島北部的安全，約瑟夫·阿基諾總統宣佈允許美國在菲律賓擁有更多的軍事基地、駐紮更多的軍隊，同時宣佈向日本自衛隊開放軍事基地，允許日本自衛隊進駐，以便日本自衛隊更好的保護正被中國軍隊嚴重威脅的南海航線和呂宋海峽航道。
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約瑟夫·阿基諾宣佈允許美日軍隊在菲律賓駐軍的當天，美國空軍和日本航空自衛隊的大量運輸機就飛抵了菲律賓的克拉克、巴薩、費爾南多、宿務、公主港、三寶壟、達沃等機場，將大量的部隊和裝備投送到了菲律賓。
日本自衛隊在此之前在非洲的吉布提擁有一個軍事基地，不過吉布提基地周圍便是中國軍隊、美軍和法軍的基地，實戰價值不大，現在菲律賓和美國允許日本在菲律賓設立軍事基地和駐軍，對於駐軍的規模，美軍沒有給出限制，這讓日本政府和自衛隊欣喜若狂。空中自衛隊成為了駐軍的急先鋒，C-運輸機滿載著空自的工程兵分隊、勘測分隊、地勤分隊和第1空降旅團的兩個營抵達了菲律賓的克拉克空軍基地、桑萊岬空軍基地和宿務馬克坦空軍基地，為後續駐軍進行探路。
美日軍隊的先遣隊進駐的時候，美日兩國軍方的代表和菲軍的代表還在菲律賓國防部大樓中商討中更詳細的駐軍方案，商討的也不只是駐軍方案，還有菲律賓軍隊的改革方案。
行動效率之高出人預料，美日菲三國軍方經過兩天的談判之後，菲律賓軍隊就拿出了改革方案，在已經部署到了菲律賓境內的美軍第步兵師第斯瑞克旅戰鬥隊和日軍第1空降旅團的支援下，改革方案被立即付諸實施。
菲律賓陸軍原本下轄的北呂宋、南呂宋、中部、西部、棉蘭老、國家首都六個地區軍區司令部進行了調整，南呂宋軍區被撤銷，併入中部軍區。從棉蘭老軍區司令位置上挪出來的新任總參謀長桑托斯·加西亞上將不希望看到有人再次上演他的做法，阿基諾家族是這次政變的最大獲益著，桑托斯·加西亞的棉蘭老軍區的作用不可估量，因為一旦菲德爾·阿基諾少將特種部隊的突襲行動失利的話，棉蘭老軍區的主力將揮師北上，支援菲德爾·阿基諾少將挽救菲律賓命運的“正義”行動。在桑托斯·加西亞上將的要求下，棉蘭老軍區被拆分成了東棉蘭老和西棉蘭老兩個軍區，軍區司令部分別設立在達沃市和潘加迪安市。
軍區進行調整的同時菲軍開始大規模徵兵，按照改革方案，菲律賓軍隊的總兵力將從11.萬人擴充到17萬人，陸軍部隊在八個步兵師、五個工兵旅、一個輕型裝甲旅、一個修建營和一個陸軍航空兵營的基礎上增加四個步兵師、一個輕型裝甲旅、三個裝甲騎兵營和兩個陸航營。空軍多個只有空架子的中隊開始補充兵員，準備接受新購買的飛機和直升機。海軍也是如此，大量的水兵被調往了蘇比克灣、甲米地桑萊岬、三寶顏、宿務海軍基地，接受美日教官的培訓，準備接受新的作戰艦艇。
美日兩國政府知道先進的武器裝備菲軍買不起、用不起，也不會用，美日兩國援助的武器裝備基本上是從儲備倉庫中拉出來的封存裝備，即便如此，菲軍也是歡喜不已，尤其是菲律賓空軍接受了日本政府贈送的二十架F-1戰鬥機後，菲律賓空軍司令恨不得抱著前來進行交接工作的日方人員親上幾口。
日本的74式主戰坦克、7式越野吉普車、OH-6輕型偵察直升機、海軍巡邏艇，讓菲律賓軍方對於日本人的好感大增，面對著日本人提出的讓菲律賓軍隊的工兵部隊幫助日本修築機場、港口和陸軍兵營的請求直接滿口答應，樂呵呵地派出接受人員跟在日本自衛隊官兵們學習這些武器裝備的使用。
美國軍隊能夠提供菲律賓的武器其實不多，主要是美軍封存的許多武器的技術含量對於學歷水平普遍不高的菲軍來說都太高了，維護成本也讓菲軍吃力。最終大量提供給菲軍的主要都是陸軍武器，並且都是菲律賓陸軍已經裝備了的型號，V-100/150輪式裝甲車、M11裝甲車、UH-1系列通用直升機等幾種主戰武器。這些武器都是免費贈送給菲軍的，但菲律賓陸軍步兵部隊的武器美國政府要求菲軍必須使用美製的，這些武器都是菲律賓政府花錢購買的，包括“陶-”反坦克導彈和“毒刺”行動式防空導彈，讓菲律賓陸軍終於裝備上了導彈武器。
除了美國和日本之外，另一個積極為菲律賓提供武器裝備的國家就有些出人意料了，不是在菲律賓政變中積極為阿基諾四世鼓吹的澳大利亞，而是在“珍珠”號人質危機中被殺了四個本國公民的韓國政府。韓國政府宣佈將再向菲律賓空軍提供八架FA-50戰鬥機，同時向菲律賓空軍贈送二十架退役的F-5E戰鬥機，更大的援助是海軍，韓國政府表示，三艘退役的“東海”級輕型護衛艦和兩艘退役的“浦項”級輕型護衛艦可以低價出售給菲律賓。
得知這個訊息的菲律賓政府立即派出了提拔為國防部長不久的維克多恩·考普斯上將率領的軍方代表團前往了首爾，與韓國政府展開進一步的談判。
“菲律賓陸軍的主要任務是肅清境內的菲共和新人民軍武裝，如果說摩伊、摩解這兩個組織會威脅到棉蘭老島的穩定的話，菲共和新人民軍威脅到的就是菲律賓的政權，他們與中國共產黨有著共同的信仰，最容易被中國政府利用，清剿他們應該是菲律賓陸軍的重中之重。菲律賓空軍和海軍的任務是在南海的黃巖島和南沙群島進行擴張，透過不斷的騷擾來遲滯中國軍隊在南海的侵略擴張。考慮到菲律賓海軍的實力較弱，美國政府會在短時間內將另外兩艘漢密爾頓級巡邏艦交付給菲律賓海軍，同時會提供低額貸款幫助菲律賓海軍將法國人扣在手中的兩艘護衛艦購回。”在維克多恩·考普斯上將抵達首爾與韓國政府和國防部的代表展開談判的時候，駐菲美軍司令威利斯·蘭茲中將也再次拜訪了約瑟夫·阿基諾總統，菲律賓軍隊享受著美國提供的福利，那他們的任務也必須承擔起來。
“如果那四艘大型戰艦能夠加入菲律賓，加上韓國政府的五艘輕型護衛艦，我們的海軍力量將會獲得極大的提升，在馬拉延群島面對中國挑釁的時候也能夠更加自信和輕鬆。”約瑟夫·阿基諾知道美國人需要的是啥，他也很樂意那樣去做。
中國製造的那些物美價廉的商品對於阿基諾家族的產業衝擊力巨大，菲共的土地改革綱領更是涉及到家族的根本利益，其實無論有無南海，約瑟夫·阿基諾和他的家族都會站在中國的對立面。（未完待續）