愛娜率領的討伐軍，很快追上了前往攻擊天蠍座的艦隊。由於愛娜在軍隊中，原本就具有的極高威望，再加上來自伊甸園議會的決意，格雷米所帶來的艦隊，全部停止了行動，並且在代理指揮官佈列尼斯·容格上校的率領下，返航伊甸園。
自此，這一場戰後最大的軍事行動，宣告結束。
這次事件，使得秘密組織天蠍座的軍事力量，受到了極大打擊。戰艦全部沉沒，MS大部分被擊毀，而更為重要的是，其指揮官米利安·皮斯科特也在戰爭中被宣佈為MIA。失去領導的天蠍座，被愛娜成功的收編，從此，其殘餘的軍事力量，被收編入伊甸園軍隊，其情報力量，被改組為了伊甸園的情報組織。
而在另一方面，指揮發起這場戰爭的格雷米·薩比艦隊，損失也極為的大。
首先是格雷米·薩比的盟友——武曼·拉坎將軍所率領的先鋒艦隊，由於後援不濟，以至於在重創天蠍座的同時，卻全軍覆沒，武曼·拉坎將軍本人，也隨著旗艦上的一眾官兵，一同殞命。
接著，便是艦隊的總指揮官格雷米·薩比。由於所乘坐的戰艦——花園號，受到了數倍於己的襲擊，結果艦上的MS隊全滅，戰艦也被擊沉，而格雷米·薩比，在未進一步確認的情況下，便被伊甸園代理執政兼軍隊最高統帥愛娜·拉芙蕾西亞單方面宣佈死亡。
不過，圍繞著格雷米·薩比的死亡，有一點十分引人注意，那就是擊沉格雷米座艦的MS，並非是愛娜所率領的討伐軍的成員，而是原本隸屬於花園號的愛麗絲·星野中尉。
關於愛麗絲·星野中尉為何要擊沉花園號，流行的有兩種解釋。
第一種解釋，是由伊甸園官方釋出的，解釋為愛麗絲·星野在得知了伊甸園議會解除了格雷米的職務後，受愛娜·拉芙蕾西亞的委託，前去勸格雷米投降，結果被格雷米拒絕，並受到生命威脅，結果在迫於無奈之下，為了自保而開槍擊沉了花園號。
當然這一種說法，由於是由伊甸園官方釋出的，故而並不被許多國家的政治學者和時政觀察員所接受。
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第二種解釋，將此一變故解釋為，愛麗絲·星野是由愛娜·拉芙蕾西亞潛派到格雷米身旁，一方面擔任間諜，刺探情報，另一方面客串暗殺者，隨時準備刺殺格雷米。故而，當愛麗絲在戰場上與愛娜碰面後，迅速變擊毀了格雷米所在的花園號。
這一種解釋，被許多人所相信，特別是其他國家的政治家和政治觀察員，但是，由於缺乏確實的證據，在廣大民眾中，這一種解釋並沒有太大的信任度。
本次事件，由於其發起人為格雷米·薩比，已經被伊甸園議會宣佈為“叛國者”，而格雷米所攻擊的目標——天蠍座，又是伊甸園所屬的秘密組織，故而，此次事件被伊甸園官方，以及大部分學者認為是伊甸園國內的內戰，或是格雷米的叛亂，故而，此次事件便被稱為“格雷米之亂”。
在本次事件中，有許許多多的謎團未得到伊甸園官方的解釋。比如愛娜·拉芙蕾西亞武裝侵入議會的舉動，比如戰場上出現的疑似ZAFT所屬的核動力MS等等。
雖說疑點重重，但是證據也相對來說極為缺乏。
如愛娜·拉芙蕾西亞侵入議會的舉動，雖然實際上已經和軍事政變沒有什麼兩樣，但是，由於在一個星期後的大選中，愛娜以高票透過，用合法的手段登上了拉芙蕾西亞共和國總統的位置，而使得那次事件也漸漸不再被人提起。
又如戰場上出現的疑似ZAFT所屬的核動力MS——量產試作型扎古，由於PLANT國內並沒有相應的記錄，而且伊甸園方面也沒有具體追究，再加上所有的量產試作型扎古都已經化為了灰燼，於是這件事也就不了了之。
總之，無論疑點、爭論如何多，這次在戰爭之後最大的一次用兵行動，最後在付出極小的代價後，就和平的收場，也算是一個完美的收場，特別是相對於那沒有發生的戰爭後最大規模的艦隊戰而言。
CE72年3月9日，殖民衛星伊甸園的港口中，一艘穿梭機正準備出發。剛剛就任拉芙蕾西亞共和國總統的愛娜·拉芙蕾西亞小姐，在萬眾矚目之下，登上了這艘穿梭機。她將要前往尤尼烏斯7的遺蹟，在那片悲劇之海上，見證戰爭的真正結束。
來到機艙中，一位身著軍服的士兵來到了愛娜的面前。
他是希羅·尤爾。雖然改裝的很好，但是愛娜的直覺告訴她，這個人就是希羅·尤爾。
愛娜默不作聲地做到了座位上，而希羅則若無其事地站在了她的身旁。
“事情做得怎麼樣？”愛娜輕聲問道。
“任務完成。阻礙和平的人，將會有不希望和平的人去對付。”希羅用著冰冷且充滿殺氣的聲音回答道。
愛娜微微點了點頭，臉上的表情十分奇特，看不出是高興，還是難過。她輕輕嘆了一口氣，隨即便將目光投向了舷窗外，那一望無際的燦爛星海。
3月10日，兩件事震撼了世界。
第一件事，在尤尼烏斯7的殘骸漂流之地，上次戰爭的各參戰國，包括PLANT、大西洋聯邦、歐亞聯邦、東亞共和國、奧布等國，簽署了停戰條約，史稱尤尼烏斯條約，該條約確立了PLANT作為國家的獨立地位，同時也對各國的軍事力量進行了限制，並且明令禁止，在戰爭中使用核技術和幻象化技術。
而同一天，另一件震撼世界的事也發生了。PLANT最高評議會穩健派的領袖，前PLANT議長西格爾·庫萊茵，在國內遭到疑似帕特里克·薩拉理念的支持者的暗殺，身中數彈，不治身亡。
西格爾·庫萊茵之死，由於兇手的身份已經確認，確實是薩拉派的支持者，故而這件事只是PLANT國內的內政，並沒有像喬治·葛倫之死那樣，造成巨大的種族矛盾。
尤尼烏斯條約的簽訂，將世界重新拉回了正路，和平的時代似乎已經到來。
但是，就算在這一天，整個世界的人都為之而高興，也有一個註定是在哭泣的。
拉克絲無力的倒在床上，眼眶已經浸溼，臉上還有幾道未乾的淚痕。
她面無表情地喃喃說道：“愛娜，就算全世界的人都被你騙過了，我也不會上當。總有一天，我一定會殺了你。”
黑暗的種子，似乎在心中種下。
拉克絲換了個姿勢，朝天躺著，她看著天花板，竟然放聲大笑了起來。
“哈哈哈……”
笑聲是那麼的勉強，又是那麼的悲傷。
那一刻，拉克絲已經不再是原先的那個拉克絲了。
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PS:終於在8月把第三卷結束了。
該死的和不該死的，這一次都死了，愛娜也成了女王，拉克絲也黑了，之後會怎麼樣，我都不敢想了。