儘管黃瓊已經制定了今後，大齊的朝廷歲入以商稅為主，農稅為輔助。但農業是根本，無糧不穩。朝廷要救災、養兵，都需要大量的糧食。若是因為負擔過重，棄地農民越來越多。那些不繳納錢糧的豪門大戶與宗室，名下土地越來越多。長期以往下去，朝廷又拿什麼養兵，又拿什麼救災？即便是大齊的整體稅賦可以說並不重，但都轉嫁到了普通民眾身上。
那就是沉重的負擔了。原本本朝稅法，是在前唐兩稅法基礎上，略加改變而來的。也就是說，朝廷徵稅除了丁稅之外，徵稅不是按照戶籍來的，而是按照土地數量來的。但隨著政體的逐步穩定，新一代的權貴大量出現，宗室日漸繁衍生息，人口基數日益龐大。從宣宗朝開始，便已經有部分宗室與勳貴開始不肯交稅。到了理宗朝開始，便是只要做了官就不用交稅。
哪怕這個官員，他們家的田地佔據了當地八成，但依舊是一文錢都錢糧都不用繳納。而這一個縣的稅賦又不能減免。否則，不單單是吏部考核名落孫山。而且別說朝廷拿什麼去養兵，就連當地縣衙師爺、差役的開支，都沒有地方著落。為了繳納朝廷的錢糧，也為了養活自己與師爺，還有縣衙的官差。一縣的稅收，自然落到了那只佔兩成土地的普通百姓身上了。
而誰都知道，這天下文官是一個龐大的群體，他們掌握著天下的話語權。若是在加上那些舉人在內，恐怕這群體的規模會更大。若是在將武官、勳貴、宗室都包括在內，這個群體幾乎囊獲了除了皇帝之外，天下所有有權勢的人。所以，即便是知道這樣一來，可謂是積弊叢生。但卻沒有人，敢去捅這個馬蜂窩。包括幾任帝王，都沒有去觸碰這個黴頭。
幾十年下來，做官便不交糧，便已經成了慣例。而那些官員不僅自己不交糧，就連親戚的土地，都可以光明正大豁免掉。到了老爺子那一代，甚至只要中了舉人之後，便可以不在繳納任何的錢糧，就更近一步減少了稅源。導致了國庫裡面窮的，連一場大災都只能拿出十萬貫錢來救災。貧者負擔越重，富者卻可以靠著手中的權利，想方設法的免稅。
這樣一來，民怨又哪裡不會沸騰？這也是黃瓊，下定決定強力推行此次變革。而且不僅為那些大土地所有者，制定的免稅條件。黃瓊也第一次，公開的徵收土地交易稅。也就是不管你是投獻的，還是購買土地的都要交稅。不僅買家要交購買土地總錢數的六成，作為土地交易稅。賣家也要繳納五成作為交易稅。若是投獻的，雙方都要繳納百分之百的稅。
為了保證該收的錢糧收上來，讓那些總是利用手中權利，想方設法逃稅的官員、士紳，勳貴、宗室，逃無可逃。黃瓊特地調整了南鎮撫司，結構以及許可權。將南鎮撫司一分為二，其中一部分專門徵收所謂的超額稅，以及各項土地交易稅。而這個衙門，不對任何的上司負責。只對黃瓊，也就是皇帝本人負責。賈權由通政司，調任這個新成立的度支司任總提舉。
若不是中書省極力反對，黃瓊甚至一度想要將各地市舶司，都劃給這個度支司管轄。最終在幾番爭議之下，黃瓊最終還是做出了妥協。雖說這個度支司，只負責收取超額稅以及土地交易稅。但戶部卻是做了一個大手術。原本專門負責徵收商稅，以及原本徵收農稅的諸路清吏司，包括戶部本身無論是從許可權還是職責上，都從根本上上做了一個大的調整。
原本管轄的各地糧倉，全部轉到了司農寺。諸路用來負責收取鹽稅、茶稅、馬稅的鹽茶馬道，也從戶部劃出。負責商稅，正常農業稅收的諸路清吏司，以及各地市舶司，都劃給了太府寺。戶部從原來的從稅收，到調撥錢糧一體負責，轉變為只負責花錢，管理全國土地名冊，以及諸路漕運。戶部下屬的鑄錢司與錢法堂，黃瓊幾經猶豫還是繼續由戶部管轄。
至於負責稅收的太府寺，以及倉儲事宜的司農寺，在幾番爭執之下。最終敲定了由中書省與尚書省共同管理。而這個變革，第一刀便砍向了宗室、勳貴，以及在任和致仕的官員。這一道明詔，直接震驚了天下。那些既得利益者，又哪裡肯放棄口中已經吞下的肥肉？更何況，他們很多人名下，包括家族名下的土地，絕大部分都全部超過了，朝廷規定的免稅上限。
讓他們每年拿出一大筆錢，來繳納這些年一直逃掉的稅錢，那幾乎等於在割他們的肉。哪怕他們已經富得流油，可依舊不想交錢。儘管他們都領著朝廷的不菲俸祿，還享受著名下土地部分免稅的優惠，但讓他們從口袋裡面掏錢，那是萬萬不能的。短短的時間之內，通政司收到的摺子，幾乎堆滿了幾間屋子。中書省那裡，每天都有致仕的官員上門辱罵。
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而各地的宗室，則擺出了一副老子是太祖皇帝後裔，落草就要享受天下供養，讓老子交錢沒門的架勢。對於這些人，黃瓊可是一點都不慣著。宗室抗稅的，直接派南鎮撫司帶走圈禁。在職的官員一般不敢，便鼓動那些致仕的官員上門鬧事。你們不是倚老賣老，仗著年紀大了，誰也不敢動你們嗎？黃瓊直接停了他們的退休待遇，什麼時候交稅了，什麼時候再恢復。
而且明詔誰在敢抗稅不交，限期三個月還不整改，名下土地直接拍賣以抵償拖欠稅錢。再不交，南鎮撫司則直接派人帶走。有兩個郡公，仗著自己資歷老。便是老爺子，都要叫一聲叔公，寧死也不肯繳納錢糧。惹惱了黃瓊直接派人，將其名下土地官賣。而且所有的土地交易稅，一律由他們擔負。這個動作一下來，原本叫囂最為厲害的宗室，首先便老實了下來。
一邊暗罵黃瓊這個皇帝，實在是太過於狡猾，一邊老老實實的開始繳納了稅錢。不圈禁、不抄家，只是強制賣掉你名下的土地。而且是全部發賣，一畝都不給你留。賣掉的錢，除了補足拖欠的錢糧，以及繳納沉重的土地交易稅之外，剩下的倒是返還給你。可地沒有了，想要再買回來，可不僅要還要再繳納一筆土地交易稅，更是還要承受收成上的損失。
最為關鍵的是，為了要在最短的時間之內補上稅，這些土地賣的往往都很便宜。不管水澆地，還是旱田都給你做一個價，往往只有市價的七成，甚至是更低。若是那些經辦官員，再暗中搞點什麼事情，或是再上下其手一番。到手的錢，可能只有市價的三成。那樣損失，可就實在是太大了。面對著這樣巨大的損失，那些他們完全負擔得起的錢糧，反倒是不算什麼。
這一看似光明正大，實則陰損之極的手段，讓那些宗室不得不乖乖的按照定製，繳納他們原本就應該繳納的稅錢。見到宗室老實下來，那些官員雖說也心有不甘，可最終也不敢硬抗。尤其是那些退休待遇被停的致仕官員，更是不敢再鬧了。他們雖說不是太在乎那點退休待遇，可問題是實在丟不起那個人。尤其是幾個硬骨頭，被抓起來枷號後，更是老實了許多。
當然，這些並不甘心丟掉既得利益的人，明面上是不敢在硬抗，但暗中依舊不老實。很多地方官員，甚至對那些士紳、豪強，抗稅的舉動睜一隻眼閉一隻眼。甚至某些學政、提學，還鼓動那些士子罷考。千里做官為了什麼，不就是為了那點特權嗎？若是沒有了特權，他們做官還有什麼意義？哪怕那點錢糧，只針對他們之中囤積土地的人，可依舊讓所有官員不滿。
而那些舉子，心中的想法與那些官員並無什麼不同。要說所有的舉子之中，沒有一個是真心為了朝廷的，那是不可能的。但大多數人做官，只不過把他看成一個職業，說白了與那些修腳的、拉縴的、釀酒、打魚種地的沒有區別。做官之後，準備苦守清寒的更沒有一個人。做官幹什麼？不就是為了掙錢，然後進行最可靠的投資，也就是買地讓家人富裕起來。
朝廷這麼做，他們的美夢豈不是破了一半？原本就有這個心思，再加上座師與考官暗中一鼓動，很多舉子便來了一個罷考。結果，他們誰都沒有想到，面對他們的這個法不責眾，甚至是讀書人高人一等的想法。黃瓊應對的手段更加的強烈，參與罷考的舉子一律全部免掉功名。不管是秀才，還是舉人，或是童生，全部統統一擼到底，什麼都不給他們留。
並且明詔，那些參與罷考的舉子，一經罷黜便永遠都不得再參加科舉。也不得參加任何形勢的舉人選官。各地無論是府試、路試，不足的名額，從那些名落孫山的士子之中，按照原來的名次替補。並且從諸路路學，以及國子監之中優先替補。你不是不想做官嗎？那就別做了，反正你不幹，有的是人幹。這個結果一下來，那些罷考的舉子都徹底傻了眼。
不僅原來十年寒窗的功名丟了，而且還永遠不得再考。這對於他們來說，無異於晴天霹靂。再鬧？再鬧便直接枷鎖，發配到寧夏府。至於那些背後鼓動的官員，南鎮撫司直接上門。你們不是不想做官了嗎？那好，就誰都別做了，直接打點行禮滾蛋吧。別說官位了，便是致仕的待遇也一律沒有。那些暗中挑事的官員，根本就不知道，早在推行這個政策之初。
黃瓊便預料到了最大，也是最強的反對者，並不是那些宗室。宗室手中沒權，實際上也沒有多少話語權。即便是分封在外的，實則也在朝廷的嚴密監控之下。便是鬧事，只要自己手段強硬一些，他們就會在最短的時日老實下來。至於勳貴，首先他們的田地並不多。而且隨著開國勳貴日益沒落，他們很多人除了那個空牌子爵位，手中便是一點權利都沒有。