分子尺度的細胞模型,是各所大學的生物實驗室一直努力建立和完善的東西。

二百年前的二十一世紀,大約2034年前後的時候,神州大地的大學與研究所,擁有的分子級別生物模型的數量,是。

生物力學實驗室的存在歷史不超過七十年。即使是在大神州,細胞模型做得最早和最豐富的,也絕非生物力學實驗室。

不過,他們實驗室的海鞘模型,嶄嶄新,足夠精細。因為年輕,所以先進。不僅僅是分子尺度的細胞模型,而且是分子級別的生物體整體模型。

模型構建者蘭澤吹噓,他可以利用附帶的計算工具,對海鞘細胞進行任意的功能修改。只要用生物化學規則計算出相應的dna序列嵌入到原來的染色體中,就可以達到修改可遺傳的效果。

現有的做dna設計的實驗室,做到的事情,也就是利用基因庫拼裝新細胞的dna。做得好的幾家都是基因庫積累比較強大的。

“你這個厲害了嘛!”仙女這麼說來著。

老羅教授專門召集實驗室全體人員,包括忙的、閒的、打雜的、日常進來溜達的,開了個會。

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他對全世界宣佈,本實驗室的海鞘數學模型暨海鞘資料動態庫可以用了。歡迎同行來,要麼膜拜要麼砸場子。

這個會開得,門都不關。

仙女等散會才進來找蘭澤。

蘭澤身邊正圍著一幫學弟學妹,個個眼中閃著膜拜的星光。以前在體育總館玩模擬器,他經常被膜拜,所以挺習慣的。

“還可以吧。”蘭澤不帶謙虛的。

“可以修改細胞的話,如果我們不知道功能對應的基因是什麼,怎麼改呢?”勤學好問的混實驗室的大四小師妹問。

“算嘛。”

“算什麼?”師妹一臉萌萌噠。

“用功能蛋白質計算dna呀。”蘭澤理所當然地說。

“哎?可以程式設計了?”仙女恍然大悟。

蘭澤沉思半晌,“你這個想法好啊。”

仙女一說,他才意識到,利用分子間作用力反推計算dna序列這件事,根本上就是程式設計嘛!

用電腦玩程式設計,他熟得很。雖然dna序列他沒玩過,但道理大致相通,規則略有不同而已。至於同一條染色體上兩端靠共振通訊,dna大長鏈各種擰麻花式調節功能,這些生物大分子的特色,正是和電腦不完全一樣,才有意思。不是嗎?

他們實驗室的樓上,以及大東研發城的研究所,都有人在做dna編程設計。不少實驗室可以在現有真核微生物的基礎上,做一些特殊功能的修改。至於病毒設計,已經有少量的成熟商業應用了。

dna和氨基酸的對照表,早在二十世紀就被人摸清楚了。光靠這個完全沒法設計出生物來。正如知道鐵是鐵,離發明訂書機還差著八百裡呢。

基因庫的大部分內容,實際上是關於各種條件下,細胞內的活動如何控制、如何操作的。以所謂“操縱元”為單位。大部分操縱元的部件,並不按順序排列在一起。有時候甚至可以跨越好幾條染色體。正是因為這樣的複雜性,基因庫中每一項新的功能單元,分析需要十分細緻。基因庫在歷史上的積累是十分緩慢的。

沒有基因庫,dna程式設計就沒有零件。

蘭澤忽然覺得,他可以再多做一點東西。比如說,寫個生化分析器代替基因庫?

計算一下生命相關的各種調控方式,各種功能性大分子,應該是可以做到的吧?

想到了,他就問道:

“你們幾個,有沒有時間,幫我做幾個驗證實驗?”

“蘭師兄,要做什麼實驗?”一群師弟妹踴躍撲了上來,“我來,我有空。”

“別急,實驗夠大家分的。”蘭澤從容地說。

“我能幫上什麼忙嗎?”仙女笑著問。

蘭澤想了想:“我想看看現有的生化分析演算法長什麼樣。”

仙女替他篩選了一些常用而又不涉密級的生化分析演算法。

蘭澤回到宿舍裡收到後,躺在床上慢慢看完,時間就挺晚的了。

他發現一件事,這些演算法挺陳舊的。

物理學和數學並不是幾百年沒有進展的學科。但是這些演算法,都建立在上百年前人類對世界認知的基礎上。

作為一個自我感覺數學不錯的人,蘭澤認為,生化分析演算法,他應該自己重寫一遍。

現有的演算法,並不太適合分析生物大分子。尤其是大型的、聚合在一起的肽鏈、核糖鏈、多肽與核糖結合在一起的複雜長鏈,往往具有打了結又繞在一起的結構這些結構是很多生物功能的基礎。但是現有的演算法,有的處理方式和算術沒什麼本質區別,有的則根本不顧這些複雜結構。

原因很簡單:術業有專攻。數學、物理和化學本來就是不同的領域。

主流演算法久經考驗,一般情況下已經足夠簡便好用,也用不著太先進。但用來處理生物微觀活動,這些演算法的效率和精度都不夠。

而被國家研究部門珍藏的,有密級的生化分析演算法,會是什麼樣,蘭澤暫時也看不到。

他琢磨完了這些現有的演算法,直接合上眼睛,打算睡覺來著。眼角好像閃過一抹藍光。

於是他舉起手環看了一眼,發現有延時訊息。

他設定過的,張荷大學姐聯絡,手環閃藍光。

“小朋友,想不想去游泳?”張大學姐的聲音特別有質感。不清脆,但是說不出的好聽。

這條訊息,按照大學姐的設定,本該在他醒來以後,才震動提醒他檢視手環,現在提前檢視到了。

“想。”蘭澤輕輕地回答了一個字。

“哎?幾點了還不睡?”

“睡不著。”蘭澤眼睛都閉上了。閉著眼說瞎話。

“睡不著,我們聊會兒天?”

“不要。”

“嗯?”

“得了。什麼時候游泳?”蘭澤迷迷糊糊地問。

“游泳啊……”

“快說時間。”蘭澤困得不行,又特別想去游泳。不管能不能遊,哪怕看看水都是好的。

“你……明天……天氣……站點……風……”蘭澤完全沒有聽清楚張荷到底說了什麼。

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