第二階段的開啟，也意味著曾經的眼鏡蛇組織進入真正的忙碌狀態，不再像是一個恐怖組織，他們所做的事情更像是特工或者間諜。
外面的局勢依然很亂，所有人都在因為之前的三次奈米蟲彈頭襲擊而人心惶惶。殺傷力強大到令人窒息，而對方釋放奈米蟲彈頭的方式更是無從防禦，這才是讓各國所擔憂的。
掩藏在這種混亂之下的，其實是另一種更加可怕的轉變，這不過這個本就隱蔽的行動，在如今的這種局勢下，就更加難以察覺。
最開始也是最困難的部分，以總統為起點，將勢力範圍擴充套件到整個美國的政治領域。政治、軍事、經濟和輿論，被葉千狐當做第一個目標的，是政治，或者軍事也可以一同進行，這兩個領域在如今的行動之中並不干擾。
既然已經遭到了華府幾近毀滅的災難，一系列高層會議自然要相繼展開，總統和他的同僚們需要對那個至今不知道身份恐怖組織做出應對，而在這些會議之中，多出一些所謂的秘密會議也是理所當然。
秘密會議，也就很適合那些秘密行動的實施，就算是有著再怎麼完備的防御機制，如果自家老大都成為了叛徒，防禦的漏洞也就比比皆是。
依然是廢墟之下的那座高科技掩體，在總統的第一次秘密會議中，麻醉氣體在悄然之間感染了參與會議的每一個人，沒有任何的抵抗，所有參與會議的高層陷入昏迷之中。
接著那道高科技掩體的中的暗門再一次開啟，這一次進入會議室的是一群醫生模樣的人，他們也確實是醫生，只不過為了防止出現意外，這些醫生也已經被注射了奈米蟲，他們的忠心可以被信賴。
奈米蟲早已經被紅後程式設計完畢，在使用麻醉氣體制服了目標之後，這些醫生以此為會議室中的高層注射奈米蟲。
因為奈米蟲一些額外的效果，這些人提前從麻醉氣體的困擾中解脫出來，但是清醒過來之後，還是那些人，但是思想已經被改變，原本的自由思想已經被奈米蟲壓制，收穫的是一個個看似正常的傀儡。
當這個開頭獲得成功之後，接下來的就更加簡單。已經被注射了奈米蟲的這些人，成為了使用奈米蟲進行控制的助力，他們開始透過自己的身份和權勢開始為葉千狐這邊的毒蛇士兵創造繼續感染其他人的條件，各種私人會晤、不是太公開的會議等等。
當受到奈米蟲感染的人越多，這個以奈米蟲為核心的堅固同盟也就越強大，這是一個此消彼長的過程，而暫時還安全的那些人卻根本就沒有意識到悄然發生的轉變，更不要說有效抵禦這種轉變的過程。
這個過程，葉千狐更傾向於稱呼他為“和平演變”。
一週之後，整個決策層百分之九十的人都已經成為了奈米蟲所控制的傀儡，隨即目標開始向國會和聯邦法院轉移，並且一部分毒蛇士兵開始感染聯邦各個州政府的決策層。
控制的範圍和程度都在加強，雖然期間發現了一些小小的挫折，但是第二階段的行動從總體而言依然可以稱之為順利。
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沒有什麼計劃是真的完美無缺的，就算是計劃本身沒有問題，但是隨著範圍的擴大，總會有一些小小的意外出現。雖然被葉千狐成為“和平演變”，但作為補充總歸還是出現了一些小規模的衝突。
所幸，在那張越發完善的勢力大網之下，都不需要動用太多的力量，已經被控制的那些高層，可以輕而易舉地將某些不太友好的隱患消除。
也正是在這種時候，多了那麼幾個人被丟進角落地摳腳，或者在馬路上遇到意外，心臟病突發之類的也並不是什麼奇怪事。
尤其是在控制了CIA和FBI之後，很多應該由毒蛇士兵進行的清理任務，乾脆就可以交給這些合法的部門特工進行處理，而且還能美其名曰為了國家安全。
確實是為了國家安全，不過不再是曾經的那個國家，因為這個國家的主人已經悄然發生的變化。
至於這個世界應該是主角的特種部隊，葉千狐並沒有對這個由多個國家的精銳組成的秘密部門動手，或者說，暫時沒有。
沒有他出現的劇情發展中，眼鏡蛇組織憑藉扎坦所取得的力量，設定陷阱圍殲特種部隊。結果清理得並不是很乾淨，又是幾個新的主角出現拯救世界。
對於眼鏡蛇組織而言，特種部隊幾乎就是他的天敵，如果找到機會，就毫不猶豫地將對方毀滅。
葉千狐卻沒有採取這種方法的意思，在他看來，這完全就是嚴重的浪費。
在控制了足夠多的高層之後，比如現在，葉千狐已經取得了對特種部隊實質性的控制權，他在北極基地下達一個命令，經過幾次轉達之後，就會變成合法的正式命令傳遞給特種部隊。
於是，打擊恐怖的特種部隊，在他們都不知道的情況下，便已經成為了葉千狐手中的一把刀。他們依然在打擊恐怖，但是目標之中偶爾會夾雜一些私貨。
還有另一把用起來更順手的，那就是原本的眼鏡蛇組織。
特種部隊現在仍然沒有發現眼鏡蛇組織的存在，以後也不會發現，因為眼鏡蛇組織已經消失了，在一些政府部門的運作下，不但清理了之前那些不利的痕跡，更是實現了合法化，成為了一個只對少數人負責的秘密部門。
特種部隊很優秀，這無可否認，但是有很多工作是不能交給特種部隊來做的。而已經合法化的眼鏡蛇組織，則成為了一個可以毫無顧忌地涉及黑暗面的秘密組織，專門負責一些比較特殊的髒活。比如，大規模使用奈米蟲建立統治網路的工作，也只能交給眼鏡蛇這種越來越多人成為毒蛇士兵的秘密組織。
這就是一塊抹布，髒了破了，可以隨手丟掉的那種。
反正，隨著控制的深入，可以用作替換的抹布只會越來越多。
至於這個新生組織的名字，葉千狐想了好久之後才發現，他真的不擅長取名字，所以，新的名字乾脆就是把眼鏡蛇組織的字首去掉，這個名字，怎麼看都是偷懶的結果。（未完待續）